Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms