Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PMCHL2Q9BQD1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms