Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP9Q99956 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms