Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms