Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms