Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms