Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC9Q92623 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms