Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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FAM71DQ8N9W8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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FAM71DQ8N9W8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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FAM71DQ8N9W8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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FAM71DQ8N9W8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FAM71DQ8N9W8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FAM71DQ8N9W8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FAM71DQ8N9W8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FAM71DQ8N9W8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FAM71DQ8N9W8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FAM71DQ8N9W8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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