Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC117Q8IWD4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms