Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PLD3Q8IV08 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PLD3Q8IV08 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PLD3Q8IV08 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLD3Q8IV08 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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