Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCQ7RTU9 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms