Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q71RC1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q71RC1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q71RC1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q71RC1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q71RC1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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