Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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