Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP135Q66GS9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms