Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSMD4Q5XG99 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms