Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms