Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms