Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA8Q53HL2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms