Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LACTB2Q53H82 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LACTB2Q53H82 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms