Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDLIM3Q53GG5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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