Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms