Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms