Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms