Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms