Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

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Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF827Q17R98 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms