Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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