Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPROQ16827 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPROQ16827 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPROQ16827 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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