Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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