Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NRF1Q16656 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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NRF1Q16656 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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