Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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CTF1Q16619 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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CTF1Q16619 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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CTF1Q16619 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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CTF1Q16619 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
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CTF1Q16619 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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CTF1Q16619 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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