Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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