Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms