Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL1Q16048 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PMCHL1Q16048 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms