Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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TAF11Q15544 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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TAF11Q15544 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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