Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PUM3Q15397 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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