Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms