Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMC1AQ14683 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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