Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms