Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GTF2H3Q13889 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GTF2H3Q13889 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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GTF2H3Q13889 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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GTF2H3Q13889 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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GTF2H3Q13889 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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GTF2H3Q13889 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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GTF2H3Q13889 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms