Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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