Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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SHROOM2Q13796 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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