Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NME3Q13232 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NME3Q13232 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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NME3Q13232 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME3Q13232 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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