Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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