Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms