Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM2Q13029 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
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