Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms