Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TWF1Q12792 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TWF1Q12792 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TWF1Q12792 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TWF1Q12792 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TWF1Q12792 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TWF1Q12792 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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TWF1Q12792 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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TWF1Q12792 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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TWF1Q12792 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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