Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms