Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAMSAP2Q08AD1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms