Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms